[Simonov50]

FO3Edit не использует список загрузки из pluginst.txt
вместо этого использует свой список (по наличию файлов в папке DATA)
в итоге fallout3.esm загружает не первым ...
Все нужные фаилы (включая pluginst.txt) находит и считывает верно.
Менял [Launcher]\bEnableFileSelection=0/1 и [Archive]\bInvalidateOlderFiles=0/1
Пробовал разные версии TES5Edit, включая последнюю (FO4Edit)
DLCList.txt - очистил (длина=0) - без изменений !
Аналогичная картина с FNVEdit - т.е. я что-то упустил в настройках для Fo3 и FNV
В Fallout4 всё прекрасно работает.

[Пакость]

Я конечно безмерно далёк от фолаута, но могу предположить что он строит свой порядок ориентируясь на времени последней модификации файлов (как собственно и TES-ы и соответственно утилиты к ним).

[zilav]

Порядок загрузки по plugins.txt ввели в Скайриме (потому что Steam Workshop сломал эту схему так как проверяет даты плагинов для обновления).

Все предыдущие игры сортируют моды по дате модификации плагинов.