Галочку "Base" вообще трогать нежелательно, если вы проводите ретекстур файлов, так как приводит к неприятным последствиям, посему никогда галочку напротив "Base" я не ставлю.
На будущее, рекомендация, которую я подглянул в теме по ОБММ (рекомендую ознакомиться, кстати :D). Когда вы закинули новые ретекстуры и собираетесь сделать валидацию, то рекомендуется перед этим отчистить изменения BSA (как я показывал на скриншоте) и после этого нажимать на кнопку "Update now". Очень помогает при некоторых багах, связанных с текстурами, вылеты игры в первую очередь.