Насколько я понял, основная проблема этого плагина в ТОМ, что Скайрим при активации модификации дозагружает файлы, и постоянно стирает строчку *SkyUI_SE в текстовом файле plagin.
Установилось нормально, после шаманства с файлом plugins все заработало.
Но нет возможности настроить мод под себя. Регистрация MCM меню была произведена, но вот в самом Пункте "Настройка Модов" ничего нет, пустой экран с эмблемой MCM.