На многие вопросы есть ответы в прилагающемся файле-справке программы, или здесь на русском...
в частности, про моды, отмеченные точкой - это моды, ВСЕ содержимое которых импортировано в башед патч... соответственно, нет необходимости загружать его отдельным плагином, занимая слот...
аналогично, моды отмеченные крестиком - моды, ЧАСТЬ информации, которых объединена в башед патч, а остальное в игре не отображается... тоже нет необходимости занимать отдельный слот...
А хорошо это или плохо... в большинстве случаев, если не провести импорт или объединение этих модов, то в игре они будут "невидимые"...