Насколько я знаю Скайрим вылетает при запуске когда не может найти мастер-файл (.esm), который требуется для одного или нескольких .esp. Отсутствующие .esm можно посмотреть в мод-менеджере. NMM показывает список нужных esm для выбранного esp, но не показывает отсутствующие, Wrye Bash определённо покажет что и где не хватает, но точно не знаю - я им не пользовался. MO - не знаю. SKSM 4.1+ также показывает эту информацию в списке файлов данных на вкладке "Зависимости": красный квадратик - файл отсутствует, синий - отключен, зелёный - всё в порядке.