Я сам не пользовался этим...
Но, могу предположить - например, один профиль можно создать сразу, тот, что у вас текущий. Зайти, как написано в справке, на закладку Сохраненные игры, в меню Профиль - Добавить...
Потом, вы меняете состав плагинов, отключая их (а не деинсталируя), может даже устанавливаете новые, создаете башед патч и после этого опять добавляете профиль.
У вас получится два профиля, между которыми можно переключатся (на той же закладке)...
Таким образом, плагины для обоих профилей должны быть изначально установлены, а активируются они программой, согласно используемому профилю...